Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAPRE3Q9UPY8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms