Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
USP22Q9UPT9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP22Q9UPT9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms