Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV3Q9UKW4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VAV3Q9UKW4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV3Q9UKW4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms