Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM8Q9UJA3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCM8Q9UJA3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms