Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIX4Q9UIU6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX4Q9UIU6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms