Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HMGXB4Q9UGU5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGXB4Q9UGU5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms