Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RRBP1Q9P2E9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RRBP1Q9P2E9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RRBP1Q9P2E9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms