Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF38Q9NXL2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF38Q9NXL2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms