Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4BQ9NPR2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA4BQ9NPR2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4BQ9NPR2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms