Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMMDC1Q9NPL8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMMDC1Q9NPL8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMMDC1Q9NPL8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMMDC1Q9NPL8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMMDC1Q9NPL8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TIMMDC1Q9NPL8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TIMMDC1Q9NPL8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMMDC1Q9NPL8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms