Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGAP3Q9NP61 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms