Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL25Q9H0H3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms