Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKD2Q9BZL6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKD2Q9BZL6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD2Q9BZL6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms