Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOL6Q9BWW8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOL6Q9BWW8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms