Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HIRIP3Q9BW71 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
HIRIP3Q9BW71 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms