Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPAS1Q99742 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS1Q99742 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms