Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SUSD3Q96L08 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD3Q96L08 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms