Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKNOX2Q96KN3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms