Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EDC3Q96F86 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
EDC3Q96F86 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EDC3Q96F86 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms