Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGF29Q96ES7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms