Protein–RNA interactions for Protein: Q96DR5

BPIFA2, BPI fold-containing family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA2Q96DR5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BPIFA2Q96DR5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPIFA2Q96DR5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms