Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
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GTF3C6Q969F1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C6Q969F1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C6Q969F1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
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