Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BEST4Q8NFU0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BEST4Q8NFU0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BEST4Q8NFU0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BEST4Q8NFU0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BEST4Q8NFU0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BEST4Q8NFU0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BEST4Q8NFU0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BEST4Q8NFU0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BEST4Q8NFU0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BEST4Q8NFU0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BEST4Q8NFU0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BEST4Q8NFU0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms