Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNLDC1Q8NA58 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PNLDC1Q8NA58 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms