Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGEF1AQ8N9B8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1AQ8N9B8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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