Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZM8

ZNF654, Zinc finger protein 654, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF654Q8IZM8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF654Q8IZM8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF654Q8IZM8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF654Q8IZM8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms