Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN12Q8IYM2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN12Q8IYM2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms