Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX6Q7RTT6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms