Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C16orf54Q6UWD8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C16orf54Q6UWD8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms