Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms