Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN10Q6JVE6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCN10Q6JVE6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms