Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms