Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACHD1Q5VU97 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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