Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ODF2Q5BJF6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ODF2Q5BJF6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms