Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPRED3Q2MJR0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRED3Q2MJR0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms