Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIRBPQ14011 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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