Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 NIPBL-208ENST00000514335 2948 ntTSL 27.19□□□□□ -1.265e-6■■■■□ 19.4
TRA2AQ13595 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.415e-6■■■■□ 19.4
TRA2AQ13595 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.465e-6■■■■□ 19.4
TRA2AQ13595 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.475e-6■■■■□ 19.4
TRA2AQ13595 TPR-207ENST00000491783 882 ntTSL 54.5□□□□□ -1.695e-6■■■■□ 19.4
TRA2AQ13595 SMARCC2-211ENST00000550859 656 ntTSL 34□□□□□ -1.772e-7■■■■□ 19.4
TRA2AQ13595 NIPBL-207ENST00000513819 452 ntTSL 33.81□□□□□ -1.85e-6■■■■□ 19.4
TRA2AQ13595 RPS6KC1-204ENST00000490299 5154 ntTSL 1 (best)3.29□□□□□ -1.885e-6■■■■□ 19.4
TRA2AQ13595 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.9□□□□□ -1.955e-6■■■■□ 19.4
TRA2AQ13595 TPR-204ENST00000469463 420 ntTSL 52.63□□□□□ -1.995e-6■■■■□ 19.4
TRA2AQ13595 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.646e-7■■■■□ 19.4
TRA2AQ13595 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.62e-8■■■■□ 19.4
TRA2AQ13595 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.262e-8■■■■□ 19.4
TRA2AQ13595 SRSF11-214ENST00000484162 4008 ntTSL 1 (best)5.73□□□□□ -1.492e-8■■■■□ 19.4
TRA2AQ13595 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.672e-8■■■■□ 19.4
TRA2AQ13595 MLLT6-209ENST00000620482 1556 ntTSL 1 (best)17.67■□□□□ 0.423e-7■■■■□ 19.3
TRA2AQ13595 MLLT6-207ENST00000618652 624 ntTSL 314.79□□□□□ -0.043e-7■■■■□ 19.3
TRA2AQ13595 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.123e-7■■■■□ 19.3
TRA2AQ13595 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.393e-7■■■■□ 19.3
TRA2AQ13595 SREK1-209ENST00000520953 2172 ntTSL 514.17□□□□□ -0.143e-7■■■■□ 19.3
TRA2AQ13595 SREK1-202ENST00000334121 6781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.833e-7■■■■□ 19.3
TRA2AQ13595 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.43e-7■■■■□ 19.3
TRA2AQ13595 SREK1-206ENST00000519259 9353 ntTSL 23.85□□□□□ -1.793e-7■■■■□ 19.3
TRA2AQ13595 SREK1-201ENST00000284041 3751 ntTSL 1 (best)3.82□□□□□ -1.83e-7■■■■□ 19.3
TRA2AQ13595 SART3-216ENST00000619503 770 ntTSL 33.67□□□□□ -1.827e-8■■■■□ 19.3
TRA2AQ13595 RSF1-210ENST00000531768 626 ntTSL 22.1□□□□□ -2.074e-6■■■■□ 19.3
TRA2AQ13595 THOC1-214ENST00000582313 1811 ntTSL 57.88□□□□□ -1.154e-7■■■□□ 19.2
TRA2AQ13595 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.324e-7■■■□□ 19.2
TRA2AQ13595 THOC1-208ENST00000580038 2033 ntTSL 56.06□□□□□ -1.444e-7■■■□□ 19.2
TRA2AQ13595 THOC1-206ENST00000579232 2277 ntTSL 54.06□□□□□ -1.764e-7■■■□□ 19.2
TRA2AQ13595 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.774e-7■■■□□ 19.2
TRA2AQ13595 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.784e-7■■■□□ 19.2
TRA2AQ13595 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.914e-7■■■□□ 19.2
TRA2AQ13595 THOC1-205ENST00000578529 2681 ntTSL 52.23□□□□□ -2.054e-7■■■□□ 19.2
TRA2AQ13595 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.468e-8■■■□□ 19.2
TRA2AQ13595 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.098e-8■■■□□ 19.2
TRA2AQ13595 DNAJC7-211ENST00000588814 1719 ntTSL 213.71□□□□□ -0.218e-8■■■□□ 19.2
TRA2AQ13595 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.278e-8■■■□□ 19.2
TRA2AQ13595 DNAJC7-207ENST00000586335 579 ntTSL 36.77□□□□□ -1.338e-8■■■□□ 19.2
TRA2AQ13595 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.171e-6■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 MIR17HG-203ENST00000582141 2845 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.071e-6■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.341e-6■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 SRRT-204ENST00000448764 1607 ntTSL 515.97■□□□□ 0.151e-6■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 DNMT1-216ENST00000588952 841 ntTSL 519.2■□□□□ 0.668e-11■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 DNMT1-211ENST00000586988 711 ntTSL 511.31□□□□□ -0.68e-11■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 NAP1L1-211ENST00000547969 543 ntTSL 43.23□□□□□ -1.894e-16■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.172e-9■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 ERGIC3-209ENST00000447986 1632 ntTSL 1 (best)12.73□□□□□ -0.372e-9■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.462e-9■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 ERGIC3-211ENST00000461043 728 ntTSL 211.8□□□□□ -0.522e-9■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 ERGIC3-205ENST00000413587 977 ntTSL 511.67□□□□□ -0.542e-9■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 ERGIC3-220ENST00000640748 832 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.572e-9■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 ERGIC3-206ENST00000416206 1235 ntTSL 511.27□□□□□ -0.612e-9■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 ERGIC3-219ENST00000496172 781 ntTSL 210.33□□□□□ -0.762e-9■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 ERGIC3-218ENST00000489071 582 ntTSL 28.36□□□□□ -1.072e-9■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 ERGIC3-214ENST00000482338 598 ntTSL 28.3□□□□□ -1.082e-9■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 TPR-206ENST00000481347 2727 ntTSL 59.74□□□□□ -0.853e-7■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.614e-7■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 PUM2-204ENST00000403432 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.834e-7■■■□□ 19.1
TRA2AQ13595 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.283e-30■■■□□ 19
TRA2AQ13595 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.193e-30■■■□□ 19
TRA2AQ13595 TNPO2-204ENST00000585886 2362 ntTSL 1 (best)14.33□□□□□ -0.123e-30■■■□□ 19
TRA2AQ13595 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.353e-30■■■□□ 19
TRA2AQ13595 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.423e-30■■■□□ 19
TRA2AQ13595 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.673e-30■■■□□ 19
TRA2AQ13595 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.675e-34■■■□□ 19
TRA2AQ13595 PRPF40A-208ENST00000472760 243 ntTSL 24.19□□□□□ -1.748e-16■■■□□ 19
TRA2AQ13595 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.35e-7■■■□□ 18.9
TRA2AQ13595 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.455e-7■■■□□ 18.9
TRA2AQ13595 ANLN-205ENST00000428612 707 ntTSL 55.15□□□□□ -1.595e-7■■■□□ 18.9
TRA2AQ13595 ANLN-208ENST00000446635 829 ntTSL 35.06□□□□□ -1.65e-7■■■□□ 18.9
TRA2AQ13595 SETD5-229ENST00000497213 552 ntTSL 44.5□□□□□ -1.694e-9■■■□□ 18.9
TRA2AQ13595 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.442e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 LUC7L-209ENST00000429378 721 ntTSL 317.59■□□□□ 0.412e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.362e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 LUC7L-207ENST00000426094 2737 ntTSL 1 (best)17■□□□□ 0.312e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.242e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.212e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 USP8-208ENST00000559329 1917 ntTSL 1 (best)14.36□□□□□ -0.119e-8■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.159e-8■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 LUC7L-213ENST00000464711 2134 ntTSL 214.02□□□□□ -0.172e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 SRSF10-212ENST00000485292 790 ntTSL 213.93□□□□□ -0.189e-8■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 LUC7L-220ENST00000495349 1006 ntTSL 213.14□□□□□ -0.312e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 LUC7L-206ENST00000419516 1211 ntTSL 513.14□□□□□ -0.312e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 LUC7L-217ENST00000490762 2643 ntTSL 1 (best)13.02□□□□□ -0.322e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.442e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 LUC7L-205ENST00000418978 989 ntTSL 511.86□□□□□ -0.512e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 USP8-212ENST00000560730 1449 ntTSL 1 (best)11.77□□□□□ -0.529e-8■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 LUC7L-210ENST00000430864 695 ntTSL 511.66□□□□□ -0.542e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 SRSF10-205ENST00000374452 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.559e-8■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 SRSF10-203ENST00000343255 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.759e-8■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 SRSF10-214ENST00000492112 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.799e-8■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 SRSF10-202ENST00000341154 2839 ntTSL 210.07□□□□□ -0.89e-8■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 SRSF10-206ENST00000374453 866 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.869e-8■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 ABCF1-205ENST00000475993 2860 ntTSL 1 (best)9.66□□□□□ -0.862e-14■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 SRSF10-210ENST00000473858 778 ntTSL 28.03□□□□□ -1.129e-8■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 SRSF10-207ENST00000453840 1808 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.139e-8■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 SRSF10-204ENST00000344989 3487 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.159e-8■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 ANKHD1-206ENST00000412116 1826 ntTSL 57.38□□□□□ -1.239e-8■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 SRSF10-215ENST00000495785 1390 ntTSL 57.18□□□□□ -1.269e-8■■■□□ 18.8
Retrieved 100 of 7,337 protein–RNA pairs in 166.5 ms