Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MYO1EQ12965 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1EQ12965 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms