Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms