Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID5AQ03989 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID5AQ03989 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms