Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
HOXC5Q00444 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms