Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF3BP55884 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms