Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIG4P49917 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIG4P49917 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIG4P49917 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIG4P49917 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIG4P49917 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIG4P49917 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIG4P49917 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIG4P49917 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIG4P49917 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIG4P49917 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIG4P49917 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIG4P49917 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIG4P49917 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIG4P49917 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIG4P49917 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIG4P49917 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIG4P49917 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIG4P49917 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIG4P49917 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIG4P49917 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIG4P49917 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIG4P49917 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIG4P49917 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIG4P49917 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIG4P49917 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIG4P49917 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIG4P49917 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIG4P49917 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIG4P49917 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIG4P49917 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIG4P49917 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIG4P49917 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIG4P49917 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIG4P49917 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIG4P49917 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIG4P49917 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIG4P49917 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG4P49917 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG4P49917 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG4P49917 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG4P49917 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG4P49917 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG4P49917 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG4P49917 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG4P49917 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG4P49917 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG4P49917 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LIG4P49917 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG4P49917 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG4P49917 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG4P49917 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG4P49917 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG4P49917 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG4P49917 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG4P49917 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG4P49917 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG4P49917 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG4P49917 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG4P49917 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG4P49917 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG4P49917 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG4P49917 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG4P49917 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG4P49917 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG4P49917 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG4P49917 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG4P49917 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG4P49917 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG4P49917 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG4P49917 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG4P49917 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG4P49917 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG4P49917 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG4P49917 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG4P49917 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG4P49917 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG4P49917 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG4P49917 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG4P49917 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG4P49917 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG4P49917 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG4P49917 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG4P49917 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG4P49917 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG4P49917 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG4P49917 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG4P49917 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG4P49917 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG4P49917 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG4P49917 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG4P49917 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG4P49917 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG4P49917 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG4P49917 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG4P49917 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG4P49917 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG4P49917 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG4P49917 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG4P49917 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms