Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT3P49223 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPINT3P49223 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms