Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYKP43405 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYKP43405 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYKP43405 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYKP43405 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYKP43405 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYKP43405 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYKP43405 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYKP43405 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYKP43405 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYKP43405 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYKP43405 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYKP43405 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYKP43405 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYKP43405 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYKP43405 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYKP43405 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYKP43405 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYKP43405 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYKP43405 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYKP43405 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYKP43405 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYKP43405 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYKP43405 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYKP43405 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYKP43405 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYKP43405 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYKP43405 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYKP43405 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYKP43405 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYKP43405 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYKP43405 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYKP43405 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYKP43405 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYKP43405 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYKP43405 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYKP43405 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYKP43405 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYKP43405 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYKP43405 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYKP43405 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYKP43405 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYKP43405 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYKP43405 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYKP43405 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYKP43405 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYKP43405 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYKP43405 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYKP43405 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYKP43405 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYKP43405 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYKP43405 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYKP43405 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYKP43405 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYKP43405 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYKP43405 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYKP43405 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYKP43405 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYKP43405 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYKP43405 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYKP43405 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYKP43405 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYKP43405 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYKP43405 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYKP43405 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYKP43405 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYKP43405 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYKP43405 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYKP43405 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYKP43405 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYKP43405 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYKP43405 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYKP43405 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYKP43405 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYKP43405 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYKP43405 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYKP43405 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYKP43405 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYKP43405 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYKP43405 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYKP43405 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYKP43405 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYKP43405 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYKP43405 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYKP43405 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYKP43405 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYKP43405 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYKP43405 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYKP43405 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYKP43405 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYKP43405 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYKP43405 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYKP43405 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SYKP43405 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYKP43405 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYKP43405 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYKP43405 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYKP43405 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYKP43405 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SYKP43405 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms