Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSPA9P38646 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSPA9P38646 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSPA9P38646 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSPA9P38646 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSPA9P38646 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSPA9P38646 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSPA9P38646 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSPA9P38646 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSPA9P38646 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HSPA9P38646 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HSPA9P38646 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPA9P38646 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPA9P38646 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms