Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFN2P35080 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFN2P35080 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFN2P35080 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFN2P35080 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFN2P35080 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFN2P35080 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFN2P35080 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFN2P35080 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFN2P35080 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFN2P35080 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFN2P35080 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFN2P35080 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFN2P35080 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFN2P35080 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFN2P35080 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFN2P35080 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFN2P35080 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFN2P35080 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFN2P35080 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PFN2P35080 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PFN2P35080 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFN2P35080 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFN2P35080 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFN2P35080 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFN2P35080 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFN2P35080 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFN2P35080 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFN2P35080 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PFN2P35080 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PFN2P35080 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PFN2P35080 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFN2P35080 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFN2P35080 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFN2P35080 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFN2P35080 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFN2P35080 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PFN2P35080 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PFN2P35080 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFN2P35080 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFN2P35080 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PFN2P35080 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFN2P35080 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFN2P35080 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFN2P35080 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFN2P35080 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PFN2P35080 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PFN2P35080 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFN2P35080 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFN2P35080 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFN2P35080 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFN2P35080 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFN2P35080 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PFN2P35080 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PFN2P35080 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFN2P35080 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PFN2P35080 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFN2P35080 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFN2P35080 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFN2P35080 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFN2P35080 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFN2P35080 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFN2P35080 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PFN2P35080 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PFN2P35080 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PFN2P35080 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFN2P35080 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PFN2P35080 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFN2P35080 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PFN2P35080 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PFN2P35080 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PFN2P35080 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PFN2P35080 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PFN2P35080 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PFN2P35080 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PFN2P35080 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PFN2P35080 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PFN2P35080 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PFN2P35080 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PFN2P35080 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PFN2P35080 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PFN2P35080 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PFN2P35080 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms