Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CMPK1P30085 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMPK1P30085 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK1P30085 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms