Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NMBRP28336 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NMBRP28336 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NMBRP28336 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NMBRP28336 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NMBRP28336 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NMBRP28336 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NMBRP28336 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NMBRP28336 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMBRP28336 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMBRP28336 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMBRP28336 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMBRP28336 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMBRP28336 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMBRP28336 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMBRP28336 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMBRP28336 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMBRP28336 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMBRP28336 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMBRP28336 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMBRP28336 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMBRP28336 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMBRP28336 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMBRP28336 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMBRP28336 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMBRP28336 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMBRP28336 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMBRP28336 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMBRP28336 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMBRP28336 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMBRP28336 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMBRP28336 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMBRP28336 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMBRP28336 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMBRP28336 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMBRP28336 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMBRP28336 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMBRP28336 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMBRP28336 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMBRP28336 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMBRP28336 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMBRP28336 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMBRP28336 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMBRP28336 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMBRP28336 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NMBRP28336 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMBRP28336 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMBRP28336 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NMBRP28336 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMBRP28336 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NMBRP28336 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NMBRP28336 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NMBRP28336 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NMBRP28336 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NMBRP28336 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NMBRP28336 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMBRP28336 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMBRP28336 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMBRP28336 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMBRP28336 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMBRP28336 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMBRP28336 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMBRP28336 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMBRP28336 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMBRP28336 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMBRP28336 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMBRP28336 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMBRP28336 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMBRP28336 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMBRP28336 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMBRP28336 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMBRP28336 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMBRP28336 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMBRP28336 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMBRP28336 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMBRP28336 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NMBRP28336 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMBRP28336 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMBRP28336 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMBRP28336 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMBRP28336 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMBRP28336 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMBRP28336 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMBRP28336 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMBRP28336 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMBRP28336 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMBRP28336 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NMBRP28336 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMBRP28336 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMBRP28336 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMBRP28336 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NMBRP28336 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NMBRP28336 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NMBRP28336 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NMBRP28336 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NMBRP28336 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NMBRP28336 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NMBRP28336 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NMBRP28336 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NMBRP28336 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms