Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTPS1P17812 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms